20.07.2014 - Новые бактерии были обнаружены в кишечнике

Анализируя генетические данные, ученым из Дании (Технический университет), удалось выявить, что кишечная флора человека имеет в своем составе бактерии (около 500), не известные ранее ученому сообществу. Кроме того, ими обнаружены восемьсот новых бактериофагов. Если изучению микробтиома уделить должное внимание, то станет более ясной природа возникновения некоторых заболеваний, а, как следствие, возможность нахождения эффективных методов их лечения. Со своими выводами они ознакомили ученое сообщество через страницы журнала Nature Biotechnology.

Для исследования использовали метод метагеномного анализа, которой помогает выполнить анализ бактерий. Составляются референсные генетические профили. Но референосное значение в данном случае оказалось намного меньше, чем найденное многообразие новых бактерий. Поэтому пришлось разработать новое направление ДНК-секвенирования, которое назвали «принципом совместной представленности» (co-abundance principle).

Метод исследования

В основе метода лежит базовое допущение, которое основано на том, взятые генетические группы могут иметь разные ДНК и могут повторяться в разных вариантах в одних и тех же образцах. Таким образом, может появиться возможность, получить все генотипы тех микроорганизмов, о которых раньше ничего не знали, не собирая при этом референсные данные.

Для исследования использовали 396 образцов микробиомов, живущих в кишечнике и получили в итоге 7500 CAGs. Таким образов стали известны новые бактерии, обитающие в кишечнике. Их всего пятьсот. До этого знали примерно около трехсот таких бактерий.

Кроме того, данное исследование помогло узнать, что время от времени микроорганизмы, долгое время живущие в кишечнике, атакуются вирусами, бактериофагами, о которых ученые раньше тоже не знали. Кто сегодня может с точностью сказать о дальнейшем развитии событий. Возможно, данные исследования, которые сегодня дают неплохие результаты, помогут создать новые препараты (для замены применяемых антибиотиков), которыми можно будет лечить различные заболевания кишечника. Таково мнение Серена Брунака.

Возможные болезни

Уже давно научно доказано, что состав кишечной флоры, его насыщенность микроорганизмами, вызывает многие заболевания. К таким заболеваниям можно отнести:

• Болезнь Крона.
• Ревматоидный артрит.
• Рассеянный склероз.